現地時間の9月23日、Anthropicは生命科学研究所チームおよび独自の分子生物学研究所を設立し、Claudeが生物学研究に参加して得た初期成果を発表しました。人間の科学者がマクロな方向性のみを提供した状況下で、Claudeは以前まで特徴付けられていなかった酵素システムを自主的に発見し、アレイ関連逆転写酵素（Array-associated Reverse Transcriptases、ART）と命名しました。この発見は旧金山湾地域の研究室から生まれ、今年春に設立された生命科学チームの初めての公開成果であり、関連するプレプリント論文は同日に掲載され、まだ査読中です。

950個のエージェントが並列処理し、21時間で新しい酵素システムを特定

Anthropicによると、研究チームがClaudeに与えた指示は、広大なDNA配列データベース内での新しい逆転写酵素の探索でした。人間の科学者の関与は最初のプロンプト設計とその後の実験検証に限られ、それ以外の作業は約950のClaudeエージェントによって並列処理されました。これらのエージェントは21時間以内に約2億語彙を消費し、20万を超える逆転写酵素の中から約3,500の新しい候補システムを抽出し、さらに20の最も分析すべき候補に絞り込み、それぞれについて人間が読みやすい分析報告書を作成しました。

最終的に、あるエージェントが一個のファージのDNA配列を処理している際に、異常な逆転写酵素遺伝子の隣に連続する繰り返し配列があることに気づきました。そのエージェントはその後、繰り返し配列の長さと間隔を計算し、既知の逆転写酵素システム構造との比較を行い、文献を検索して以前に関連する報告があるかどうかを確認しました。AnthropicはARTを3つの部分から構成されていると説明しています：逆転写酵素そのもの、その周辺にある補助遺伝子、そして均等に間隔を空けた非コードDNAの繰り返し配列；この繰り返し配列はCRISPR配列に似ており、論文では3〜21個の短い繰り返しコピーを含んでおり、初期実験ではそれらが異なる短いRNAとして発現し、生物学的活性を持つことが示されています。ただし、ARTの正確な機能は現在不明であり、それが安定的かつ制御可能に遺伝子編集に利用できるかどうかを検証するには大量の追加実験が必要です。

張锋が称賛し、アモデイは機能の検証を認める

CRISPR遺伝子編集の先駆者であるマサチューセッツ工科大学およびBroad研究所の教授である張鋒は、プレプリント論文を審査した後、AIエージェントが生物学の発見を促進する画期的な事例であると述べました。RNA繰り返し配列の識別は「非常に注目すべきことで、さらに深く研究する価値がある」と語り、より多くの科学者がAIが研究をサポートする方法を探求することを希望しています。AnthropicのCEOであるダリオ・アモデイはX上で、この発見は他の人々の過去の仕事に基づいていることを認めています。スタンフォード大学のグループが「いくつかの点において類似している」体系を記述していたためです。彼は同時に、この発見の「大部分は」Claudeによって行われたものの、「すべてではない」ことを強調し、システムの正確な機能と生物技術の実用性は「現在明らかになっていない」と述べました。

Anthropicは、実験室がBSL-1/BSL-2レベルの研究のみを行っており、人間を感染させる病原体は取り扱っておらず、すべての湿式実験は人間の科学者が行い、Claudeはデータマイニング、仮説生成、データ分析を担当しています。同社は、このようなゲノムマイニングが規模化されれば、専門家が通常何週間乃至何ヶ月かかる分析を数時間に圧縮できるとし、科学者と協力してこの手法をゲノミクスや他の分野に拡張したいと考えています。